1997. aastal loodi Eesti Vabariigi Kultuuriministeeriumi eestvedamisel Eestisse filmifond Eesti Filmi Sihtasutus, mis suunas ja jagas riiklikku filmieelarvet. Filmitööstuse areng, tehnoloogilised muutused ja rahastamissüsteemide mitmekesistumine nõudsid aga laiemat lähenemist valdkonnale. Seepärast reorganiseeriti filmifond 2013. aastal Eesti Filmi Instituudiks (EFI).
Juriidiliselt on EFI riiklik sihtasutus, mille põhifinantseerija on Kultuuriministeerium. Instituudil on kolm peategevust: filmivaldkonna arendus ja turundus, filmide tootmine ja filmipärandi eest hoolitsemine. Filmipärandiosakond tegeleb lisaks filmikirjaoskuse edendamisega. Instituut tegeleb ka Film Estonia tagasimaksesüsteemiga, mille kaudu filmi- ja teletootmisettevõtted saavad tagasi taotleda kuni 30% kohalikest abikõlblikest tootmiskuludest ning organiseerib iga aasta toimuvat Eesti Filmi-ja Teleauhindade Gaalat (EFTA).
EFI struktuuris on tütarettevõte Tallinnfilm, mis toimetab peavoolu filmidele alternatiivi pakkuva kinona, ja programmi Loov Euroopa MEDIA Infolaud, mis vahendab teavet Euroopa Liidu toetuste ja koolitusvõimaluste kohta filmivaldkonnas.
Eesti Filmi Instituudi eesmärk on olla avatud ja kättesaadav filmitegijatele, seista selle eest, et film säiliks Eesti kultuuri osana, ning muuta Eesti film rahvusvaheliselt nähtavamaks ja konkurentsivõimelisemaks.